github.com/jingcheng-WU/gonum@v0.9.1-0.20210323123734-f1a2a11a8f7b/mat/hogsvd_example_test.go (about) 1 // Copyright ©2017 The Gonum Authors. All rights reserved. 2 // Use of this source code is governed by a BSD-style 3 // license that can be found in the LICENSE file. 4 5 package mat_test 6 7 import ( 8 "fmt" 9 "log" 10 11 "github.com/jingcheng-WU/gonum/mat" 12 ) 13 14 func ExampleHOGSVD() { 15 // Perform an HOGSVD factorization on food production/consumption data for the 16 // three years 1990, 2000 and 2014. 17 // 18 // See Ponnapalli et al. doi:10.1371/journal.pone.0028072 and 19 // Alter at al. doi:10.1073/pnas.0530258100 for more details. 20 var gsvd mat.HOGSVD 21 ok := gsvd.Factorize(FAO.Africa, FAO.Asia, FAO.LatinAmericaCaribbean, FAO.Oceania) 22 if !ok { 23 log.Fatalf("HOGSVD factorization failed: %v", gsvd.Err()) 24 } 25 26 for i, n := range []string{"Africa", "Asia", "Latin America/Caribbean", "Oceania"} { 27 var u mat.Dense 28 gsvd.UTo(&u, i) 29 s := gsvd.Values(nil, i) 30 fmt.Printf("%s\n\ts_%d = %.4f\n\n\tU_%[2]d = %.4[4]f\n", 31 n, i, s, mat.Formatted(&u, mat.Prefix("\t "))) 32 } 33 34 var v mat.Dense 35 gsvd.VTo(&v) 36 fmt.Printf("\nCommon basis vectors\n\n\tVᵀ = %.4f", 37 mat.Formatted(v.T(), mat.Prefix("\t "))) 38 39 // Output: 40 // 41 // Africa 42 // s_0 = [45507.3278 18541.9293 21503.0778] 43 // 44 // U_0 = ⎡-0.0005 -0.0039 -0.0019⎤ 45 // ⎢-0.0010 -0.0007 -0.0012⎥ 46 // ⎢-1.0000 -0.0507 -0.9964⎥ 47 // ⎢-0.0022 -0.2906 -0.0415⎥ 48 // ⎢ 0.0001 -0.0127 -0.0016⎥ 49 // ⎢ 0.0003 -0.0067 -0.0010⎥ 50 // ⎢ 0.0003 -0.0022 -0.0003⎥ 51 // ⎢-0.0086 -0.9550 0.0734⎥ 52 // ⎢ 0.0017 0.0002 0.0059⎥ 53 // ⎢-0.0002 -0.0088 -0.0014⎥ 54 // ⎢-0.0006 -0.0078 -0.0001⎥ 55 // ⎢-0.0005 -0.0076 0.0003⎥ 56 // ⎢ 0.0001 -0.0090 0.0008⎥ 57 // ⎢-0.0005 -0.0050 0.0029⎥ 58 // ⎢-0.0011 -0.0078 -0.0012⎥ 59 // ⎢-0.0014 -0.0058 -0.0002⎥ 60 // ⎢ 0.0007 -0.0095 0.0020⎥ 61 // ⎢-0.0008 -0.0081 -0.0009⎥ 62 // ⎢ 0.0004 -0.0092 0.0006⎥ 63 // ⎢-0.0007 -0.0079 -0.0006⎥ 64 // ⎣-0.0011 -0.0076 -0.0010⎦ 65 // Asia 66 // s_1 = [77228.2804 8413.7024 14711.1879] 67 // 68 // U_1 = ⎡ 0.0005 -0.0080 0.0011⎤ 69 // ⎢ 0.0008 -0.0108 0.0016⎥ 70 // ⎢-0.9998 0.0612 0.9949⎥ 71 // ⎢ 0.0007 -0.5734 -0.0468⎥ 72 // ⎢ 0.0001 -0.0265 -0.0022⎥ 73 // ⎢ 0.0001 -0.0165 -0.0019⎥ 74 // ⎢ 0.0000 -0.0070 -0.0013⎥ 75 // ⎢ 0.0196 -0.8148 0.0893⎥ 76 // ⎢ 0.0002 -0.0063 0.0012⎥ 77 // ⎢-0.0001 -0.0135 -0.0013⎥ 78 // ⎢-0.0004 -0.0135 0.0019⎥ 79 // ⎢-0.0005 -0.0132 0.0014⎥ 80 // ⎢ 0.0003 -0.0155 0.0045⎥ 81 // ⎢-0.0003 -0.0130 0.0025⎥ 82 // ⎢-0.0007 -0.0105 0.0016⎥ 83 // ⎢-0.0006 -0.0129 0.0007⎥ 84 // ⎢-0.0006 -0.0178 -0.0023⎥ 85 // ⎢-0.0003 -0.0149 0.0016⎥ 86 // ⎢-0.0001 -0.0134 0.0030⎥ 87 // ⎢-0.0004 -0.0154 0.0010⎥ 88 // ⎣-0.0009 -0.0147 -0.0019⎦ 89 // Latin America/Caribbean 90 // s_2 = [274.1364 20736.3116 729.6947] 91 // 92 // U_2 = ⎡ 0.1060 -0.0021 0.0174⎤ 93 // ⎢ 0.1415 -0.0016 0.0289⎥ 94 // ⎢ 0.2350 -0.2669 -0.9212⎥ 95 // ⎢ 0.0290 -0.0118 -0.0429⎥ 96 // ⎢ 0.0226 -0.0043 -0.0213⎥ 97 // ⎢ 0.0117 -0.0016 -0.0197⎥ 98 // ⎢-0.6263 -0.9635 0.2234⎥ 99 // ⎢ 0.2334 -0.0013 0.1275⎥ 100 // ⎢-0.0358 -0.0085 -0.0498⎥ 101 // ⎢-0.1238 -0.0054 0.0313⎥ 102 // ⎢-0.0421 -0.0059 0.0528⎥ 103 // ⎢-0.1471 -0.0056 0.0350⎥ 104 // ⎢-0.2158 -0.0052 -0.0044⎥ 105 // ⎣-0.6154 -0.0078 -0.2717⎦ 106 // Oceania 107 // s_3 = [8954.1914 6942.6316 17233.0561] 108 // 109 // U_3 = ⎡-0.0080 -0.0012 -0.0040⎤ 110 // ⎢ 0.0004 -0.0014 0.0001⎥ 111 // ⎢ 0.9973 -0.0315 0.9991⎥ 112 // ⎢ 0.0473 -0.7426 -0.0359⎥ 113 // ⎢ 0.0018 -0.0342 -0.0020⎥ 114 // ⎢-0.0005 -0.0148 -0.0016⎥ 115 // ⎢-0.0004 -0.0047 -0.0007⎥ 116 // ⎢-0.0246 -0.6642 -0.0138⎥ 117 // ⎢ 0.0003 -0.0287 -0.0023⎥ 118 // ⎢-0.0011 -0.0148 -0.0014⎥ 119 // ⎢-0.0108 -0.0198 -0.0039⎥ 120 // ⎢-0.0149 -0.0183 -0.0048⎥ 121 // ⎢-0.0178 -0.0208 -0.0075⎥ 122 // ⎢-0.0266 -0.0063 -0.0016⎥ 123 // ⎢-0.0012 -0.0234 -0.0006⎥ 124 // ⎢-0.0084 -0.0184 -0.0030⎥ 125 // ⎢-0.0232 -0.0191 -0.0124⎥ 126 // ⎢-0.0072 -0.0226 -0.0035⎥ 127 // ⎢-0.0150 -0.0144 -0.0045⎥ 128 // ⎢-0.0068 -0.0227 -0.0034⎥ 129 // ⎣-0.0127 -0.0136 -0.0049⎦ 130 // 131 // Common basis vectors 132 // 133 // Vᵀ = ⎡-0.0897 -0.4460 -0.8905⎤ 134 // ⎢-0.4911 -0.5432 -0.6810⎥ 135 // ⎣ 0.0644 0.2841 0.9566⎦ 136 }