golang.org/x/exp@v0.0.0-20240506185415-9bf2ced13842/shootout/fasta-1000.txt (about)

     1  >ONE Homo sapiens alu
     2  GGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGA
     3  TCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACT
     4  AAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAG
     5  GCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCG
     6  CCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGT
     7  GGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCA
     8  GGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAA
     9  TTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAG
    10  AATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCA
    11  GCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGT
    12  AATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACC
    13  AGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTG
    14  GTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACC
    15  CGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAG
    16  AGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTT
    17  TGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACA
    18  TGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCT
    19  GTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGG
    20  TTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGT
    21  CTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG
    22  CGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCG
    23  TCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTA
    24  CTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCG
    25  AGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCG
    26  GGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACC
    27  TGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAA
    28  TACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGA
    29  GGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACT
    30  GCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTC
    31  ACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGT
    32  TCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC
    33  CGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCG
    34  CTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTG
    35  GGCGACAGAGCGAGACTCCG
    36  >TWO IUB ambiguity codes
    37  cttBtatcatatgctaKggNcataaaSatgtaaaDcDRtBggDtctttataattcBgtcg
    38  tactDtDagcctatttSVHtHttKtgtHMaSattgWaHKHttttagacatWatgtRgaaa
    39  NtactMcSMtYtcMgRtacttctWBacgaaatatagScDtttgaagacacatagtVgYgt
    40  cattHWtMMWcStgttaggKtSgaYaaccWStcgBttgcgaMttBYatcWtgacaYcaga
    41  gtaBDtRacttttcWatMttDBcatWtatcttactaBgaYtcttgttttttttYaaScYa
    42  HgtgttNtSatcMtcVaaaStccRcctDaataataStcYtRDSaMtDttgttSagtRRca
    43  tttHatSttMtWgtcgtatSSagactYaaattcaMtWatttaSgYttaRgKaRtccactt
    44  tattRggaMcDaWaWagttttgacatgttctacaaaRaatataataaMttcgDacgaSSt
    45  acaStYRctVaNMtMgtaggcKatcttttattaaaaagVWaHKYagtttttatttaacct
    46  tacgtVtcVaattVMBcttaMtttaStgacttagattWWacVtgWYagWVRctDattBYt
    47  gtttaagaagattattgacVatMaacattVctgtBSgaVtgWWggaKHaatKWcBScSWa
    48  accRVacacaaactaccScattRatatKVtactatatttHttaagtttSKtRtacaaagt
    49  RDttcaaaaWgcacatWaDgtDKacgaacaattacaRNWaatHtttStgttattaaMtgt
    50  tgDcgtMgcatBtgcttcgcgaDWgagctgcgaggggVtaaScNatttacttaatgacag
    51  cccccacatYScaMgtaggtYaNgttctgaMaacNaMRaacaaacaKctacatagYWctg
    52  ttWaaataaaataRattagHacacaagcgKatacBttRttaagtatttccgatctHSaat
    53  actcNttMaagtattMtgRtgaMgcataatHcMtaBSaRattagttgatHtMttaaKagg
    54  YtaaBataSaVatactWtataVWgKgttaaaacagtgcgRatatacatVtHRtVYataSa
    55  KtWaStVcNKHKttactatccctcatgWHatWaRcttactaggatctataDtDHBttata
    56  aaaHgtacVtagaYttYaKcctattcttcttaataNDaaggaaaDYgcggctaaWSctBa
    57  aNtgctggMBaKctaMVKagBaactaWaDaMaccYVtNtaHtVWtKgRtcaaNtYaNacg
    58  gtttNattgVtttctgtBaWgtaattcaagtcaVWtactNggattctttaYtaaagccgc
    59  tcttagHVggaYtgtNcDaVagctctctKgacgtatagYcctRYHDtgBattDaaDgccK
    60  tcHaaStttMcctagtattgcRgWBaVatHaaaataYtgtttagMDMRtaataaggatMt
    61  ttctWgtNtgtgaaaaMaatatRtttMtDgHHtgtcattttcWattRSHcVagaagtacg
    62  ggtaKVattKYagactNaatgtttgKMMgYNtcccgSKttctaStatatNVataYHgtNa
    63  BKRgNacaactgatttcctttaNcgatttctctataScaHtataRagtcRVttacDSDtt
    64  aRtSatacHgtSKacYagttMHtWataggatgactNtatSaNctataVtttRNKtgRacc
    65  tttYtatgttactttttcctttaaacatacaHactMacacggtWataMtBVacRaSaatc
    66  cgtaBVttccagccBcttaRKtgtgcctttttRtgtcagcRttKtaaacKtaaatctcac
    67  aattgcaNtSBaaccgggttattaaBcKatDagttactcttcattVtttHaaggctKKga
    68  tacatcBggScagtVcacattttgaHaDSgHatRMaHWggtatatRgccDttcgtatcga
    69  aacaHtaagttaRatgaVacttagattVKtaaYttaaatcaNatccRttRRaMScNaaaD
    70  gttVHWgtcHaaHgacVaWtgttScactaagSgttatcttagggDtaccagWattWtRtg
    71  ttHWHacgattBtgVcaYatcggttgagKcWtKKcaVtgaYgWctgYggVctgtHgaNcV
    72  taBtWaaYatcDRaaRtSctgaHaYRttagatMatgcatttNattaDttaattgttctaa
    73  ccctcccctagaWBtttHtBccttagaVaatMcBHagaVcWcagBVttcBtaYMccagat
    74  gaaaaHctctaacgttagNWRtcggattNatcRaNHttcagtKttttgWatWttcSaNgg
    75  gaWtactKKMaacatKatacNattgctWtatctaVgagctatgtRaHtYcWcttagccaa
    76  tYttWttaWSSttaHcaaaaagVacVgtaVaRMgattaVcDactttcHHggHRtgNcctt
    77  tYatcatKgctcctctatVcaaaaKaaaagtatatctgMtWtaaaacaStttMtcgactt
    78  taSatcgDataaactaaacaagtaaVctaggaSccaatMVtaaSKNVattttgHccatca
    79  cBVctgcaVatVttRtactgtVcaattHgtaaattaaattttYtatattaaRSgYtgBag
    80  aHSBDgtagcacRHtYcBgtcacttacactaYcgctWtattgSHtSatcataaatataHt
    81  cgtYaaMNgBaatttaRgaMaatatttBtttaaaHHKaatctgatWatYaacttMctctt
    82  ttVctagctDaaagtaVaKaKRtaacBgtatccaaccactHHaagaagaaggaNaaatBW
    83  attccgStaMSaMatBttgcatgRSacgttVVtaaDMtcSgVatWcaSatcttttVatag
    84  ttactttacgatcaccNtaDVgSRcgVcgtgaacgaNtaNatatagtHtMgtHcMtagaa
    85  attBgtataRaaaacaYKgtRccYtatgaagtaataKgtaaMttgaaRVatgcagaKStc
    86  tHNaaatctBBtcttaYaBWHgtVtgacagcaRcataWctcaBcYacYgatDgtDHccta
    87  >THREE Homo sapiens frequency
    88  aacacttcaccaggtatcgtgaaggctcaagattacccagagaacctttgcaatataaga
    89  atatgtatgcagcattaccctaagtaattatattctttttctgactcaaagtgacaagcc
    90  ctagtgtatattaaatcggtatatttgggaaattcctcaaactatcctaatcaggtagcc
    91  atgaaagtgatcaaaaaagttcgtacttataccatacatgaattctggccaagtaaaaaa
    92  tagattgcgcaaaattcgtaccttaagtctctcgccaagatattaggatcctattactca
    93  tatcgtgtttttctttattgccgccatccccggagtatctcacccatccttctcttaaag
    94  gcctaatattacctatgcaaataaacatatattgttgaaaattgagaacctgatcgtgat
    95  tcttatgtgtaccatatgtatagtaatcacgcgactatatagtgctttagtatcgcccgt
    96  gggtgagtgaatattctgggctagcgtgagatagtttcttgtcctaatatttttcagatc
    97  gaatagcttctatttttgtgtttattgacatatgtcgaaactccttactcagtgaaagtc
    98  atgaccagatccacgaacaatcttcggaatcagtctcgttttacggcggaatcttgagtc
    99  taacttatatcccgtcgcttactttctaacaccccttatgtatttttaaaattacgttta
   100  ttcgaacgtacttggcggaagcgttattttttgaagtaagttacattgggcagactcttg
   101  acattttcgatacgactttctttcatccatcacaggactcgttcgtattgatatcagaag
   102  ctcgtgatgattagttgtcttctttaccaatactttgaggcctattctgcgaaatttttg
   103  ttgccctgcgaacttcacataccaaggaacacctcgcaacatgccttcatatccatcgtt
   104  cattgtaattcttacacaatgaatcctaagtaattacatccctgcgtaaaagatggtagg
   105  ggcactgaggatatattaccaagcatttagttatgagtaatcagcaatgtttcttgtatt
   106  aagttctctaaaatagttacatcgtaatgttatctcgggttccgcgaataaacgagatag
   107  attcattatatatggccctaagcaaaaacctcctcgtattctgttggtaattagaatcac
   108  acaatacgggttgagatattaattatttgtagtacgaagagatataaaaagatgaacaat
   109  tactcaagtcaagatgtatacgggatttataataaaaatcgggtagagatctgctttgca
   110  attcagacgtgccactaaatcgtaatatgtcgcgttacatcagaaagggtaactattatt
   111  aattaataaagggcttaatcactacatattagatcttatccgatagtcttatctattcgt
   112  tgtatttttaagcggttctaattcagtcattatatcagtgctccgagttctttattattg
   113  ttttaaggatgacaaaatgcctcttgttataacgctgggagaagcagactaagagtcgga
   114  gcagttggtagaatgaggctgcaaaagacggtctcgacgaatggacagactttactaaac
   115  caatgaaagacagaagtagagcaaagtctgaagtggtatcagcttaattatgacaaccct
   116  taatacttccctttcgccgaatactggcgtggaaaggttttaaaagtcgaagtagttaga
   117  ggcatctctcgctcataaataggtagactactcgcaatccaatgtgactatgtaatactg
   118  ggaacatcagtccgcgatgcagcgtgtttatcaaccgtccccactcgcctggggagacat
   119  gagaccacccccgtggggattattagtccgcagtaatcgactcttgacaatccttttcga
   120  ttatgtcatagcaatttacgacagttcagcgaagtgactactcggcgaaatggtattact
   121  aaagcattcgaacccacatgaatgtgattcttggcaatttctaatccactaaagcttttc
   122  cgttgaatctggttgtagatatttatataagttcactaattaagatcacggtagtatatt
   123  gatagtgatgtctttgcaagaggttggccgaggaatttacggattctctattgatacaat
   124  ttgtctggcttataactcttaaggctgaaccaggcgtttttagacgacttgatcagctgt
   125  tagaatggtttggactccctctttcatgtcagtaacatttcagccgttattgttacgata
   126  tgcttgaacaatattgatctaccacacacccatagtatattttataggtcatgctgttac
   127  ctacgagcatggtattccacttcccattcaatgagtattcaacatcactagcctcagaga
   128  tgatgacccacctctaataacgtcacgttgcggccatgtgaaacctgaacttgagtagac
   129  gatatcaagcgctttaaattgcatataacatttgagggtaaagctaagcggatgctttat
   130  ataatcaatactcaataataagatttgattgcattttagagttatgacacgacatagttc
   131  actaacgagttactattcccagatctagactgaagtactgatcgagacgatccttacgtc
   132  gatgatcgttagttatcgacttaggtcgggtctctagcggtattggtacttaaccggaca
   133  ctatactaataacccatgatcaaagcataacagaatacagacgataatttcgccaacata
   134  tatgtacagaccccaagcatgagaagctcattgaaagctatcattgaagtcccgctcaca
   135  atgtgtcttttccagacggtttaactggttcccgggagtcctggagtttcgacttacata
   136  aatggaaacaatgtattttgctaatttatctatagcgtcatttggaccaatacagaatat
   137  tatgttgcctagtaatccactataacccgcaagtgctgatagaaaatttttagacgattt
   138  ataaatgccccaagtatccctcccgtgaatcctccgttatactaattagtattcgttcat
   139  acgtataccgcgcatatatgaacatttggcgataaggcgcgtgaattgttacgtgacaga
   140  gatagcagtttcttgtgatatggttaacagacgtacatgaagggaaactttatatctata
   141  gtgatgcttccgtagaaataccgccactggtctgccaatgatgaagtatgtagctttagg
   142  tttgtactatgaggctttcgtttgtttgcagagtataacagttgcgagtgaaaaaccgac
   143  gaatttatactaatacgctttcactattggctacaaaatagggaagagtttcaatcatga
   144  gagggagtatatggatgctttgtagctaaaggtagaacgtatgtatatgctgccgttcat
   145  tcttgaaagatacataagcgataagttacgacaattataagcaacatccctaccttcgta
   146  acgatttcactgttactgcgcttgaaatacactatggggctattggcggagagaagcaga
   147  tcgcgccgagcatatacgagacctataatgttgatgatagagaaggcgtctgaattgata
   148  catcgaagtacactttctttcgtagtatctctcgtcctctttctatctccggacacaaga
   149  attaagttatatatatagagtcttaccaatcatgttgaatcctgattctcagagttcttt
   150  ggcgggccttgtgatgactgagaaacaatgcaatattgctccaaatttcctaagcaaatt
   151  ctcggttatgttatgttatcagcaaagcgttacgttatgttatttaaatctggaatgacg
   152  gagcgaagttcttatgtcggtgtgggaataattcttttgaagacagcactccttaaataa
   153  tatcgctccgtgtttgtatttatcgaatgggtctgtaaccttgcacaagcaaatcggtgg
   154  tgtatatatcggataacaattaatacgatgttcatagtgacagtatactgatcgagtcct
   155  ctaaagtcaattacctcacttaacaatctcattgatgttgtgtcattcccggtatcgccc
   156  gtagtatgtgctctgattgaccgagtgtgaaccaaggaacatctactaatgcctttgtta
   157  ggtaagatctctctgaattccttcgtgccaacttaaaacattatcaaaatttcttctact
   158  tggattaactacttttacgagcatggcaaattcccctgtggaagacggttcattattatc
   159  ggaaaccttatagaaattgcgtgttgactgaaattagatttttattgtaagagttgcatc
   160  tttgcgattcctctggtctagcttccaatgaacagtcctcccttctattcgacatcgggt
   161  ccttcgtacatgtctttgcgatgtaataattaggttcggagtgtggccttaatgggtgca
   162  actaggaatacaacgcaaatttgctgacatgatagcaaatcggtatgccggcaccaaaac
   163  gtgctccttgcttagcttgtgaatgagactcagtagttaaataaatccatatctgcaatc
   164  gattccacaggtattgtccactatctttgaactactctaagagatacaagcttagctgag
   165  accgaggtgtatatgactacgctgatatctgtaaggtaccaatgcaggcaaagtatgcga
   166  gaagctaataccggctgtttccagctttataagattaaaatttggctgtcctggcggcct
   167  cagaattgttctatcgtaatcagttggttcattaattagctaagtacgaggtacaactta
   168  tctgtcccagaacagctccacaagtttttttacagccgaaacccctgtgtgaatcttaat
   169  atccaagcgcgttatctgattagagtttacaactcagtattttatcagtacgttttgttt
   170  ccaacattacccggtatgacaaaatgacgccacgtgtcgaataatggtctgaccaatgta
   171  ggaagtgaaaagataaatat